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User:Freetrashbox/DiameterJ

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| category = [[:Category:Plugins|Plugins]] [[:Category:Analysis|Analysis]]
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'''DiameterJ'''<ref name="Hotaling">Hotaling NA, Bharti K, Kriel H, Simon Jr. CG. DiameterJ: A validated open source nanofiber diameter measurement tool. Biomaterials 2015;61:327–38. doi:10.1016/j.biomaterials.2015.05.015 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0142961215004652</ref>はフリーでオープンソースのImageJ、ImageJ 2、Fiji用プラグインです。National Institute of Standards and Technologyで開発されました。DiameterJは検証済みのナノファイバーの直径解析ツールです。DiameterJは画像を分析し、ナノファイバーまたはマイクロファイバーの繊維軸方向に沿った直径を見つけることができ、得られたデータのヒストグラムを作成します。一般的な統計情報、たとえば平均繊維径、繊維径の最頻値(mode)なども求められます。 DiameterJ also bundles なども求められます。DiameterJには[http://bigwww.epfl.ch/demo/orientation/ OrientationJ]が付属しており<ref name="OrientationJ"/>R. Rezakhaniha, A. Agianniotis, J. T. C. Schrauwen, A. Griffa, D. Sage, C. V. C. Bouten, F. N. van de Vosse, M. Unser and N. Stergiopulos, Experimental investigation of collagen waviness and orientation in the arterial adventitia using confocal laser scanning microscopy, Biomechanics and modeling in mechanobiology, SpringerLink (DOI: 10.1007/s10237-011-0325-z)<、ImageJ/ref> for a complete analysis of fiber orientation within an image as well as the Fijiの"Analyze Particles" function built into ImageJ/Fiji to analyze pore space within scaffolds and produce summary statistics for pores. のような感じで繊維の方向を分析することができ、これにより孔径や孔に関する統計情報を得ることもできます。
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== References ==
{{reflist|refs=<ref name="OrientationJ">R. Rezakhaniha, A. Agianniotis, J. T. C. Schrauwen, A. Griffa, D. Sage, C. V. C. Bouten, F. N. van de Vosse, M. Unser and N. Stergiopulos, Experimental investigation of collagen waviness and orientation in the arterial adventitia using confocal laser scanning microscopy, Biomechanics and modeling in mechanobiology, SpringerLink (DOI: 10.1007/s10237-011-0325-z)</ref>}}
== External Links ==
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