<html>
<head>
<meta name="generator" content="Windows Mail 17.5.9600.20689">
<style type="text/css"><!--html { font-family: "Color Emoji", "Calibri", "Segoe UI", "Meiryo", "Microsoft YaHei UI", "Microsoft JhengHei UI", "Malgun Gothic", "sans-serif"; }--></style><style data-externalstyle="true"><!--
p.MsoListParagraph, li.MsoListParagraph, div.MsoListParagraph {
margin-top:0in;
margin-right:0in;
margin-bottom:0in;
margin-left:.5in;
margin-bottom:.0001pt;
}
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal {
margin:0in;
margin-bottom:.0001pt;
}
p.MsoListParagraphCxSpFirst, li.MsoListParagraphCxSpFirst, div.MsoListParagraphCxSpFirst, 
p.MsoListParagraphCxSpMiddle, li.MsoListParagraphCxSpMiddle, div.MsoListParagraphCxSpMiddle, 
p.MsoListParagraphCxSpLast, li.MsoListParagraphCxSpLast, div.MsoListParagraphCxSpLast {
margin-top:0in;
margin-right:0in;
margin-bottom:0in;
margin-left:.5in;
margin-bottom:.0001pt;
line-height:115%;
}
--></style></head>
<body dir="ltr">
<div data-externalstyle="false" dir="ltr" style="font-family: 'Calibri', 'Segoe UI', 'Meiryo', 'Microsoft YaHei UI', 'Microsoft JhengHei UI', 'Malgun Gothic', 'sans-serif';font-size:12pt;"><div style="color: rgb(0, 0, 0);">Hi Thorsten, </div><div style="color: rgb(0, 0, 0);"><br></div><div style="color: rgb(0, 0, 0);">I think the way is to wrap your image into a ARGBType ImgLib2 images. </div><div style="color: rgb(0, 0, 0);">But you would have to change TrackMate because right now the GUI refuses to start with a RGB image. </div><div style="color: rgb(0, 0, 0);"><br></div><div style="color: rgb(0, 0, 0);">Best</div><div style="color: rgb(0, 0, 0);">jy<br></div><div style="color: rgb(0, 0, 0);" data-signatureblock="true"><div style="color: rgb(0, 0, 0);"><br></div><div style="color: rgb(0, 0, 0);"><br>--<br>Jean-Yves Tinevez<br>PFID - Imagopole<br>Institut Pasteur<br>25-28, rue du Docteur Roux<br>75724 Paris cedex 15 <br>France<br>mob: +33 7 88 17 97 69<br>tel: +33 1 45 68 82 18<br>fax: +33 1 44 38 92 54</div><div style="color: rgb(0, 0, 0);"><br></div></div><div style="padding-top: 5px; border-top-color: rgb(229, 229, 229); border-top-width: 1px; border-top-style: solid;"><div><font face=" 'Calibri', 'Segoe UI', 'Meiryo', 'Microsoft YaHei UI', 'Microsoft JhengHei UI', 'Malgun Gothic', 'sans-serif'" style='line-height: 15pt; letter-spacing: 0.02em; font-family: "Calibri", "Segoe UI", "Meiryo", "Microsoft YaHei UI", "Microsoft JhengHei UI", "Malgun Gothic", "sans-serif"; font-size: 12pt;'><b>De :</b> <a href="mailto:wagner@biomedical-imaging.de" target="_parent">Thorsten Wagner</a><br><b>Envoyé :</b> ‎lundi‎ ‎9‎ ‎mars‎ ‎2015 ‎20‎:‎47<br><b>À :</b> <a href="mailto:imagej-devel@imagej.net" target="_parent">imagej-devel@imagej.net</a></font></div></div><div><br></div><div dir=""><div id="readingPaneBodyContent">Dear list,<br><br>I currently want to extend TrackMate with a spot feature for RGB Stacks.<br>I want to calculate the hue of the center for each spot to filter the<br>particle by color before connecting the dots to tracks.<br><br>However, TrackMate uses ImgLib2 and I wondering how to work with RGB<br>Stack images. I cant find any examples how to do that.<br><br>Any help is highly appreciated!<br><br>Cheers,<br>Thorsten<br><br><br><br>_______________________________________________<br>ImageJ-devel mailing list<br>ImageJ-devel@imagej.net<br>http://imagej.net/mailman/listinfo/imagej-devel<br></div></div></div>
</body>
</html>