<div dir="ltr">Hi Hadrien,<div><br></div><div> Thanks for reporting this. I finally tracked it down when working on updating File > Export > Image... and File > Import > Image... to use the fixes to OME-TIFF writing[1].</div><div><br></div><div> The issue has to do with whether or not the JFileChooser is enabled[2]. A temporary workaround should be just to enable the use of the JFileChooser. I'm hoping to have an actual fix soon though.</div><div><br></div><div>Thanks again!</div><div>- Mark</div><div><br></div><div>[1] <a href="http://imagej.net/pipermail/imagej-devel/2015-January/002407.html">http://imagej.net/pipermail/imagej-devel/2015-January/002407.html</a></div><div>[2] <a href="https://github.com/imagej/imagej-legacy/issues/101">https://github.com/imagej/imagej-legacy/issues/101</a></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 14, 2015 at 12:57 PM, Hadrien Mary <span dir="ltr"><<a href="mailto:hadrien.mary@gmail.com" target="_blank">hadrien.mary@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I'd like to report a bug I noticed some time ago.<br>
<br>
I have an error when I try to save an OME Tiff file with File > Export<br>
> Image (to save it as an OME Tiff format). Note that it works well<br>
when the saved image is not an OME Tiff file.<br>
<br>
The bug is weird.<br>
<br>
First when I click File > Export > Image, gtk file manager open to ask<br>
where I want to save the file. The default filename is test.ometif<br>
(instead of test.ome.tif, current filename). I change the filename to<br>
be test.ome.tif (same bug when I don't change it) and when I click<br>
"save", I have this message :<br>
<br>
------------------------------------<br>
(Fiji Is Just) ImageJ 2.0.0-rc-21/1.49m; Java 1.7.0_65 [64-bit]; Linux<br>
3.13.0-44-generic; 80MB of 3600MB (2%)<br>
<br>
java.lang.RuntimeException: java.util.concurrent.ExecutionException:<br>
java.lang.IllegalArgumentException<br>
at net.imagej.legacy.DefaultLegacyService.runLegacyCompatibleCommand(DefaultLegacyService.java:256)<br>
at net.imagej.legacy.DefaultLegacyHooks.interceptRunPlugIn(DefaultLegacyHooks.java:160)<br>
at ij.IJ.runPlugIn(IJ.java)<br>
at ij.Executer.runCommand(Executer.java:131)<br>
at ij.Executer.run(Executer.java:64)<br>
at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)<br>
Caused by: java.util.concurrent.ExecutionException:<br>
java.lang.IllegalArgumentException<br>
at java.util.concurrent.FutureTask.report(FutureTask.java:122)<br>
at java.util.concurrent.FutureTask.get(FutureTask.java:188)<br>
at net.imagej.legacy.DefaultLegacyService.runLegacyCompatibleCommand(DefaultLegacyService.java:252)<br>
... 5 more<br>
Caused by: java.lang.IllegalArgumentException<br>
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)<br>
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:57)<br>
at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)<br>
at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:606)<br>
at org.scijava.util.ReflectedUniverse.exec(ReflectedUniverse.java:314)<br>
at net.imagej.DefaultDatasetService.save(DefaultDatasetService.java:327)<br>
at net.imagej.DefaultDatasetService.save(DefaultDatasetService.java:310)<br>
at net.imagej.plugins.commands.io.SaveAsImage.run(SaveAsImage.java:101)<br>
at org.scijava.command.CommandModule.run(CommandModule.java:201)<br>
at org.scijava.module.ModuleRunner.run(ModuleRunner.java:167)<br>
at org.scijava.module.ModuleRunner.call(ModuleRunner.java:126)<br>
at org.scijava.module.ModuleRunner.call(ModuleRunner.java:65)<br>
at org.scijava.thread.DefaultThreadService$2.call(DefaultThreadService.java:164)<br>
at java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java:262)<br>
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145)<br>
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615)<br>
... 1 more<br>
------------------------------------<br>
<br>
I currently use BF exporter function which is working well for my<br>
daily use. So don't rush on this.<br>
<br>
Thank you<br>
<br>
--<br>
Hadrien Mary<br>
<br>
Ph.D student in Biology<br>
Tournier-Gachet Team<br>
CNRS - LBCMCP - UMR 5088<br>
<br>
Université de Toulouse - Bât. 4R3B1<br>
118, route de Narbonne - 31062 Toulouse<br>
<br>
_______________________________________________<br>
ImageJ-devel mailing list<br>
<a href="mailto:ImageJ-devel@imagej.net">ImageJ-devel@imagej.net</a><br>
<a href="http://imagej.net/mailman/listinfo/imagej-devel" target="_blank">http://imagej.net/mailman/listinfo/imagej-devel</a><br>
</blockquote></div><br></div>