<div dir="ltr">Hi Mohamed,<div><br></div><div><div>> Before the latest updates, I used to be able to open tif files with</div><div>> ij2. Now I am getting an error (see below for the warnings I get when</div><div>> loading ij launcher and the error after trying to open a "tif" file).</div>

</div><div><br></div><div>Thank you for the bug report, and very sorry for the long delay in reply.</div><div><br></div><div>I believe these problems are resolved on the master branch, as well as in the last few releases (latest is 2.0.0-beta-7.5). At least, I am able to successfully open TIFF files on my system.</div>

<div><br></div><div>Could you please let us know if this problem persists for you?</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Curtis</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 30, 2013 at 11:33 AM, Mohamed Tleis <span dir="ltr"><<a href="mailto:mohammedtleis@hotmail.com" target="_blank">mohammedtleis@hotmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  

    
  
  <div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <div style="font-family:-moz-fixed;font-size:12px" lang="x-western">Dear Developers,
      <br>
      <br>
      I wonder whether this is important for you.
      <br>
      <br>
      Before the latest updates, I used to be able to open tif files
      with ij2. Now I am getting an error (see below for the warnings I
      get when loading ij launcher and the error after trying to open a
      "tif" file).
      <br>
      <br>
      Note that If I switch to Legacy mode, open the image, then back
      into modern mode , things work fine.
      <br>
      <br>
      However, I still am wondering if the Invalid services in the
      warning messages is something specific to my machine. Am I missing
      some package?
      <br>
      <br>
      run:
      <br>
      ...
      <br>
      log4j:WARN No appenders could be found for logger
      (io.scif.Format).
      <br>
      log4j:WARN Please initialize the log4j system properly.
      <br>
      ...
      <br>
      [WARNING] Invalid service: imagej.data.lut.DefaultLUTService
      <br>
      ....
      <br>
      [WARNING] Overridden plugin ij.plugin.AboutBox is blacklisted
      <br>
      [WARNING] Overridden plugin ij.plugin.Commands("quit") is
      blacklisted
      <br>
      ...
      <br>
      [WARNING] Invalid service: io.scif.services.LuraWaveServiceImpl
      <br>
      [WARNING] Invalid service:
      ome.xml.services.DefaultOMEXMLMetadataService
      <br>
      [WARNING] Invalid service: ome.xml.services.OMEXMLServiceImpl
      <br>
      ...
      <br>
      // Trying to open a tif file
      <br>
      [ERROR] Module threw exception
      <br>
      java.lang.NullPointerException
      <br>
          at
      imagej.data.lut.io.LUTIOPlugin.supportsOpen(LUTIOPlugin.java:66)
      <br>
          at
      imagej.io.DefaultIOService.getOpener(DefaultIOService.java:68)
      <br>
          at imagej.io.DefaultIOService.open(DefaultIOService.java:87)
      <br>
          at imagej.core.commands.io.OpenFile.run(OpenFile.java:87)
      <br>
          at imagej.command.CommandModule.run(CommandModule.java:163)
      <br>
          at imagej.module.ModuleRunner.run(ModuleRunner.java:169)
      <br>
          at imagej.module.ModuleRunner.call(ModuleRunner.java:126)
      <br>
          at imagej.module.ModuleRunner.call(ModuleRunner.java:67)
      <br>
          at
      java.util.concurrent.FutureTask$Sync.innerRun(FutureTask.java:334)
      <br>
          at java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java:166)
      <br>
          at
java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1110)<br>
          at
java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:603)<br>
          at java.lang.Thread.run(Thread.java:722)
      <br>
      <br>
      Best Regards,
      <br>
      Mohamed Tleis
      <br>
    </div>
  </div>

<br>_______________________________________________<br>
ImageJ-devel mailing list<br>
<a href="mailto:ImageJ-devel@imagej.net">ImageJ-devel@imagej.net</a><br>
<a href="http://imagej.net/mailman/listinfo/imagej-devel" target="_blank">http://imagej.net/mailman/listinfo/imagej-devel</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>