<div dir="ltr">I have created a number of bug reports in our trac database related to these issues. See comments below for more information. Michael, you are CCed on all tickets. Thanks for reporting these.<br><div class="gmail_extra">
<br>---------- Forwarded message ----------<br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">From: <b class="gmail_sendername">Michael Schmid</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:schmid@iap.tuwien.ac.at" target="_blank">schmid@iap.tuwien.ac.at</a>></span><br>

Date: Tue, Oct 23, 2012 at 7:22 AM<br>Subject: Re: ImageJ 2.0.0-beta5 released<br>To: Curtis Rueden <<a href="mailto:ctrueden@wisc.edu" target="_blank">ctrueden@wisc.edu</a>><br>Cc: Michael Schmid <<a href="mailto:schmid@iap.tuwien.ac.at" target="_blank">schmid@iap.tuwien.ac.at</a>><br>


<br><br>Hi Curtis,<br>
<br>
finally I had time to look at it - not bad at all!  Especially cleaning up some Roi/overlay and 'composite image/channels' issues of IJ1 is good approach!<br>
<br>
Here are a few points that I have encountered - I have not delved into how to create tickets in a formally correct way. If appropriate, could you enter them or forward to someone for entering?<br>
<br>
Image>Adjust>Auto-Contrast for 32-bit float images always gave an incredibly high number as minimum (it seems to be Double.MAX_VALUE):<br>
179,769,313,486,231,570,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000,000<br>



Obviously, then it does not display the image with reasonable contrast.<br>
</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1805">http://trac.imagej.net/ticket/1805</a><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">Also, large numbers like this should be displayed in exponential format.<br>
<br>
Image>Adjust/Brightness contrast does not accept exponential notation like 1e2 with lowercase 'e'.<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1807">http://trac.imagej.net/ticket/1807</a></div>
<div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">
<br>
Image>Adjust/Brightness overrides the input if one has a small range for a 32-bit image (e.g. if I want to see the range 0 to 0.0001 in an image with range -10 to 10). Then, if I want to set the minimum, it also destroys my previous maximum setting, and other way round.<br>
</div></div></div></blockquote><div><br></div><div style>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1809">http://trac.imagej.net/ticket/1809</a></div><div style> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">


<br>
Image>Adjust/Brightness Usability: A 'full range' or 'default' button (brightness=50, contrast=50) would be welcome.<br>
<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1810">http://trac.imagej.net/ticket/1810</a></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">
Analyze>Histogram plot does not work for 32-bit float image<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div style>Recently the Histogram Plot command was improved. Support of float images is one of the enhancements in place.</div>
<div style> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">

<br>
Image>Duplicate should allow to enter the name of the copy and suggest a NEW name as default, such as "blobs-1" for image "blobs"<br>
<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1811">http://trac.imagej.net/ticket/1811</a></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">
Windows menu should list all open windows.<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div style>This is a known issue we plan to address. See: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/441">http://trac.imagej.net/ticket/441</a></div>
<div style> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">

<br>
Currently, IJ2 keeps all selections; it's like IJ1 with the shift key pressed when drawing further selections (at least under OS X 10.6.8, Java 1.6.0_35). I prefer the IJ1 behavior, that drawing a selection deletes the old one(s) unless shift is pressed.<br>



If you keep it like this, deleting an overlay/Roi must be easier: e.g. right-click on it and have a context menu entry 'Delete overlay' or 'delete selection'.<br>
<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div style>IJ2 keeps all selections (and auto populates the Overlay Manager) by design. The issue of context menus for overlays (including delete) is known and will be addressed. See: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1084">http://trac.imagej.net/ticket/1084</a></div>
<div> <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">

Selecting an image by clicking into it (while a selection tool is active in the toolbar) should not create a new Roi (maybe unless the user drags to extend the roi).  Even worse, clicking on the white space below an image (if the window is larger than the image, such as for the 'Blobs' sample, see also ticket #1060) currently also creates a new Roi.<br>



<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1813">http://trac.imagej.net/ticket/1813</a></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">
On a German keyboard, the '+' key is currently mapped to 'Show all' instead of 'Zoom in'. On this keyboard, it delivers the keyCode 93, which corresponds to ']' on a US keyboard. Similarily, the '-' key does not work for 'Zoom Out', because on a German keyboard it delivers keyCode 47, the same as the slash on US keyboards. The Numpad + and - keys are ok.<br>



<br></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Entered as trac ticket: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1814">http://trac.imagej.net/ticket/1814</a></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div><div class="gmail_quote">
Creating a selection on an image shown at a zoom level different from 100% can cause the image to snap back to 100% zoom. (OS X 10.6.8, Java 1.6.0_35)<br>
<br></div></div></div></blockquote><div style><br></div><div style>This is a known issue we plan to address. See: <a href="http://trac.imagej.net/ticket/1189">http://trac.imagej.net/ticket/1189</a></div><div style><br></div>
</div></div></div>