<html>
    <head>
      <base href="http://fiji.sc/bugzilla/" />
    </head>
    <body>
      <p>
        <div>
            <b><a class="bz_bug_link 
          bz_status_NEW "
   title="NEW - Issue with the Stitching plugin (Grid/collection stitching)"
   href="http://fiji.sc/bugzilla/show_bug.cgi?id=1234#c4">Comment # 4</a>
              on <a class="bz_bug_link 
          bz_status_NEW "
   title="NEW - Issue with the Stitching plugin (Grid/collection stitching)"
   href="http://fiji.sc/bugzilla/show_bug.cgi?id=1234">bug 1234</a>
              from <span class="vcard"><a class="email" href="mailto:jan.eglinger@gmail.com" title="Jan Eglinger <jan.eglinger@gmail.com>"> <span class="fn">Jan Eglinger</span></a>
</span></b>
        <pre>(In reply to suzel from <a href="show_bug.cgi?id=1234#c3">comment #3</a>)
<span class="quote">> If I stitch the entire set of images using the 'position from files'
> sub-routine, the stitching work fine,</span >

In 'positions from file', do you use the 'Defined by TileConfiguration' or the
'Defined by image metadata' mode?

If using a TileConfiguration.txt file worked for you, you can edit that file to
include only the files of interest.
If using image metadata (which more likely if understood you correctly), a
workaround might be to re-save the files to tiff *without* their metadata and
then use row-by-row as you tried.

What format are you using? OME-Tiff?</pre>
        </div>
      </p>
      <hr>
      <span>You are receiving this mail because:</span>
      
      <ul>
          <li>You are the assignee for the bug.</li>
      </ul>
    </body>
</html>